Организация была зарегистрирована 1 ноября 1995 года. Его учредителями были известные общественные, политические и культурные деятели страны: Василий Быков (он же первый председатель Наблюдательного Сейма БХК), Рыгор Бородулин, Радим Горецкий, Светлана Алексиевич, Геннадий Буравкин, Юрий Гадыко, Карлос Шерман и другие.
Белорусский Хельсинкский Комитет работает ради того, чтобы "реанимировать смыслы прав человека и чтобы права человека были включены во все сферы жизни". Ежегодно составляет Национальный индекс прав человека. Этот индекс создает группа экспертов гражданского общества под общей координацией БХК путем общей оценки ситуации с правами человека и по трем категориям (социально-экономические права, гражданско-политические права и общие меры в области прав человека) оцениваем конкретные права, их компоненты и индикаторы идеальной ситуации.
В сентябре 2021 года власти лишили БХК регистрации, но организация продолжила свою деятельность. С июля 2022 года организация имеет консультативный статус при ЭКОСОС ООН.
Глава организации Олег Гулак — лауреат Франко-немецкой премии "За права человека и верховенство закона".
